作为世界上最早种植水稻的国家，水稻在我国粮食生产中起着举足轻重的作用。随着外国一流育种公司开始重视中国市场，我国大豆、棉花等重要作物的种子市场已先后沦陷。水稻作为我国最重要的粮食作物，是保证我国粮食安全的关键。
华大基因李瑞强博士介绍，新中国成立以来，我国的水稻育种水平一直处于世界前列，水稻亩产量先后实现了三次飞跃。尽管我国的杂交水稻技术目前在国际上处于领先地位，但随着国际育种公司加速基因资源的争夺、新的优质品种不断涌现，如果不加强分子育种技术研究，我们的水稻育种研究将面临被国际水平赶超的危险。
我国科学家曾于2002年率先合作完成籼稻基因组框架图与精细图的绘制工作，并在国际著名学术期刊《科学》发表科学专论。华大凭借其世界领先的高通量测序平台，生物信息学分析平台和转基因平台，力图推动水稻基因组学研究的另一次革命。目前已完成400多个水稻基因的转基因克隆工作，依托华大基因强大的高通量测序技术，今后将进一步加快水稻转基因育种研究工作。
