协议明确重点合作领域是：加强农产品流通布局和生产布局的衔接，重点支持在主产区和关键物流结点建设若干大型专业性农产品批发市场；加强大型连锁企业与农业生产基地的对接，帮助生产和市场主体打造稳定的产销关系；加强商品生产和市场消费需求的衔接，建立解决“买难”、“卖难”问题的协调机制；加强农产品流通标准化建设，提高农产品质量，完善蔬菜瓜果质量追溯体系；加强肉品安全监管协作，实现肉品质量安全信息可追溯系统与动物标识及疫病可追溯系统对接；推动农产品品牌建设，提升农产品市场竞争力和产品附加值；互通农产品市场信息，共同维护农产品市场平稳有序运行；加强农业贸易工作，提高我国农业贸易管理水平，推进实施农业“走出去”战略。
